トラジェクトリーツール
この項の概要
この項ではMF myPrestoのトラジェクトリーツールの操作手順を説明します。
[トラジェクトリー]タブにある、下記(1)~(7)いずれかのボタンをクリックし、[トラジェクトリーツール]のダイアログを開きます。ダイアログには下記に関連するタブが配置されており、クリックして切り替えることができます。
(1) 原子の座標を計測(2) 2原子間の距離を計測(3) 3原子間の角度を計測(4) 2面角を計測(5) RMSD(6) トラジェクトリーフレームの削除(7) トラジェクトリープレイヤー
上記(1)~(4)の機能では原子のindexを指定し、座標トラジェクトリーの各フレームの(1)~(4)の値をテキスト出力します。 上記(5)の機能では表示設定同様の原子選択式を使い、選択した部分のRMSDをテキスト出力します。 上記(6)の機能ではトラジェクトリーのフレーム数を指定して、トラジェクトリーの一部フレームの削除を行います。 上記(7)では座標トラジェクトリーのアニメーションの再生が行えます。
水素結合
[水素結合]のボタンをクリックすると、座標トラジェクトリの各構造について水素結合を計算し、分子表示設定に水素結合の設定を追加します。