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分子動力学(MD)計算用PCクラスタ

弊社では分子動力学計算プログラムをプリインストールしたPCもしくはPCクラスタの販売を行っております。分子動力学計算プログラムはAmber、NAMD、GROMACSから選択、ハードウェア(PCもしくはPCクラスタ)はDELL、HP、オリジナルPCクラスタ等から選択できます。

ご購入いただいて直ぐに並列環境で分子動力学計算を行うことができるよう環境をセットアップいたします。

セットアップ価格 (MDプログラム + プリインストール作業 + 1ヶ月オンコールサポート)

 

   1) Amber

\220,000(税別)

   2) NAMD

\100,000(税別)

   3) GROMACS

\100,000(税別)

プリインストール作業: OS(CentOS), MPI, ネットワーク設定
(セットアップについて、ご希望がある場合はお問い合わせください)

※上記のAmberはアカデミック向けの価格です。

※対応可能ノード数は1-64 ノードです。
 6ノード以上の場合には別途インストール作業費がかかります。

 

ハードウェア 

  • ハードウェアの構成及び仕様は、DELL、HP、オリジナルPCクラスタ等からご予算、ご要望によりカスタマイズいたします。

  • OSはCentOS, Redhat, openSUSEから選択できます。

  • Infinibandも対応可能です。

  • 価格: 構成と仕様により異なります。

オリジナルPCクラスタ Hyperion Cluster for MD

hyperion※上図はイメージです。

価格:\606,000(税別) (※2014年6月16日現在)

価格は情勢により変動する場合がございます。

お問い合わせの際は、価格も併せてお問い合わせください。

 

仕様:下記の通り

管理ノード
SI-3770

CPU

Corei7 4790S

(3.2GHz, 4core)

計算ノード
x4台

CPU

Corei7 4790S

(3.2GHz, 4core)

GPU

NVIDIA GeForce GTX650

GPU

オンボード

メモリ

8GB

メモリ

8GB

ケース

ミニタワー

ケース

スリム

モニタ

24inch (1920 x1080)

付属品

8ポートGigabit Hub, Keyboard, Mouse, Cables, アルミラック

 

 

その他

  • GPU計算機と組み合わせた以下のセットアップも用意できます。

  • NAMD + CUDA(マルチGPU) 

    ※圧力制御の計算には対応しておりません。

参考) NAMD vs NAMD+CUDA の実計算時間比較(Apoa1 500 steps, 92K atoms)

NVIDIA GeForce GTX260 CUDA

01'38.00

core i7 (8 processor)

02'22.40