クイックスタートガイド

概要

ここではMF myPrestoの操作手順を、短いステップにまとめて紹介しています。詳細なマニュアルにつきましては、製品同梱のPDFや、MF myPrestoの[ヘルプ]メニューの資料をご参照ください。

Contents:

• 1. 画面説明
• 2. [ファイル]メニュー
• 3. [ホーム]タブ
  • 3.1. データの貼り付け/切り取り/コピー
  • 3.2. 新しいシーンの作成/複製/削除
  • 3.3. 分子データのマージ
  • 3.4. 分子データの分離
  • 3.5. 原子選択
• 4. [タンパク質編集]タブ
  • 4.1. 対称分子の計算
  • 4.2. 鎖の削除選択
  • 4.3. 残基編集
  • 4.4. 分子の重ね合わせ配置
  • 4.5. Hを生やす
  • 4.6. 分子表現設定
• 5. [リガンド編集]タブ
  • 5.1. 原子座標の回転/並進移動、結合軸回転
  • 5.2. 結合の追加
  • 5.3. 原子団の追加
  • 5.4. 原子の種類の変更と削除
  • 5.5. Hを生やす
  • 5.6. リガンドの2次元の構造の3次元化
  • 5.7. リガンドの構造最適化
  • 5.8. 電荷計算
  • 5.9. 合成容易性予測
  • 5.10. 分子を中心に表示
• 6. [MD]タブ
  • 6.1. 軸の整列
  • 6.2. 水付加
  • 6.3. イオンの付加
  • 6.4. tplgeneX実行
  • 6.5. Minimize/MD
• 7. [トラジェクトリー]タブ
  • 7.1. トラジェクトリーツール
  • 7.2. グラフ表示
• 8. [ドッキング]タブ
  • 8.1. ポケット予測
  • 8.2. プローブ点の作成
  • 8.3. プローブ点の削除
  • 8.4. グリッドポテンシャルの作成
  • 8.5. ドッキングシミュレーション
• 9. [スクリーニング]タブ
  • 9.1. 3DdataConstruction
  • 9.2. スクリーニング