sievgeneについて

Easy myPresto v3.7には以下のバージョンのsievgeneが収録されています。

 

sievgene_pack240118, sievgene_dual

 

また、プラットフォーム毎に以下のバイナリを収録しています。

 

<MFmyPrestoインストールディレクトリー> / sievgene / bin

 

sievgene_d(.exe)

グリッドポテンシャルのセル数60

 

sievgene.g100(.exe)

グリッドポテンシャルのセル数100

 

sievgene.g120(.exe)

グリッドポテンシャルのセル数120

扱えるデータの制限について

Easy myPrestoに付属しているsievgeneは以下の制限があります。

 

最大原子数

100,000

最大分子数(分子の種類)

100

最大分子鎖数

60,000

最大結合パラメータ

120,000

最大結合角パラメータ

120,000

最大2面角パラメータ

200,000

最大2面角パラメータ(Improper)

50,000

グリッドポテンシャルのセル数(XYZ)

60, 100, 120

(3つから選択)

sievgeneバイナリの設定

Easy myPrestoに付属のsievgeneではなく、別途ご用意していただいたsievgeneをご利用することもできます。この場合は使用するsievgeneのパスを指定する必要があります。

 

手順は以下の通りです。

 

1.[ファイル]メニュー[オプション(O)…をクリックします。

 

 [環境設定]ダイアログが表示されます。

 

 

2.myPrestoタブの[ローカルPCグループのsievgene:コンボボックスにローカルPCで利用するsievgeneバイナリをフルパスで入力します。(bundle)と入力するとEasy myPrestoに付属のsievgeneが選択されます。

 

 

 Sievgene ドッキング計算