分子のサーフィスを作成/編集したい

例1.タンパク質のサーフィスを作成する

  1. シークエンスビュー、または選択パネルのいずれかでタンパク質を選びます。

    Note

    選択する手順は 分子の一部を選択して編集したい をご参照ください。


  1. [形状]タブにある[サーフィス]で[追加]ボタンをクリックします。

    Note

    手順1で選択した部分に対してサーフィスが作成されます。

    _images/MakeSurface3.png

  1. サーフィスのリストで、対象のサーフィスを選び[設定]ボタンをクリックすると、サーフィスの表示に関する設定を変更できます。

    _images/MakeSurface1.png

  1. 必要に応じて設定を変更し、[更新]ボタンをクリックします。主な設定項目は下記のとおりです。

    タイプ:

    VDW surfaceやAccessible surfaceなど、サーフィスのタイプを選びます。

    カラー:

    [指定色][静電ポテンシャル][分子カラーと同じ]など、サーフィスの色分けを選びます。

    分子表面のみサーフィスを作成:

    チェックを入れるとアミノ酸/核酸の表面だけサーフィスを作ります。

    品質:

    数字が大きい程、サーフィスを作る際のポリゴンの分割数が多くなり、分解能が上がります。

    _images/MakeSurface2.png